uitgestorvenvogels

De volledige chloroplast-genoomsequentie van Quercus

De volledige chloroplast-genoomsequentie van Quercus chungii (Fagaceae)

Quercus chungii  FPMetcalf, een zeldzame eik die endemisch is in Zuid-China, behoort tot de stam van de samengestelde trichomenbasis (CTB) in de   sectie Cyclobalanopsis . Het volledige chloroplast-genoom van de soort werd in deze studie verzameld en geannoteerd.

Het circulaire genoom was 160.731 bp groot, met een typische quadripartiete structuur, waaronder een groot single-copy-gebied (LSC, 90.140 bp), een klein single-copy-gebied (SSC, 18.911 bp) en twee kopieën van inverted repeat-regio’s (IR’s). , 25.840 bp). Het codeerde in totaal 113 unieke genen, waaronder 79 eiwitcoderende genen, 30 tRNA-genen en vier rRNA-genen.

Genoomsequenties van humaan cytomegalovirus stam TB40/E varianten vermeerderd in fibroblasten en epitheelcellen

De komst van sequencing van het hele genoom heeft onthuld dat gewone laboratoriumstammen van humaan cytomegalovirus (HCMV) grote genetische tekortkomingen hebben als gevolg van seriële passage in fibroblasten. In het bijzonder gaat tropisme voor epitheel- en endotheelcellen verloren door mutaties die de genen UL128, UL130 of UL131A verstoren, die coderen voor subeenheden van een virion-geassocieerd pentamerisch advanced (PC) dat belangrijk is voor virale toegang tot deze cellen, maar niet voor toegang tot fibroblasten. De aan endotheelcellen aangepaste stam TB40/E heeft een relatief intact genoom en is naar voren gekomen als een laboratoriumstam die sterk lijkt op het wildtype virus. Er bestaan ​​echter verschillende heterogene TB40/E-aandelen en gekloonde varianten die een reeks sequentie- en tropisme-eigenschappen vertonen.

Hier rapporteren we het gebruik van PacBio-sequencing om de genetische veranderingen op te helderen die plaatsvonden, zowel op consensusniveau als binnen subpopulaties, bij het passeren van een TB40 / E-voorraad op ARPE-19-epitheelcellen. De lang gelezen gegevens vergemakkelijkten ook het onderzoek van de koppeling tussen mutaties. In overeenstemming met inefficiënte ARPE-19-celinvoer, bevatte ten minste 83% van de virale genomen die aanwezig waren vóór aanpassing veranderingen die van invloed waren op pc-subeenheden. In tegenstelling, en constant met het belang van de laptop voor toegang tot endotheel- en epitheelcellen, misten genomen na aanpassing deze of aanvullende mutaties die van invloed waren op pc-subeenheden.

De sequentiegegevens onthulden ook zes enkele niet-coderende substituties in de geïnverteerde herhalingsgebieden, enkele niet-synonieme substituties in genen UL26, UL69, US28 en UL122, en een frameshift-afknotgen UL141. Van de veranderingen die van invloed zijn op eiwitcoderende regio’s, werd alleen die in UL122 sterk geselecteerd. Deze verandering, resulterend in een D390H-substitutie in het gecodeerde eiwit IE2, is eerder betrokken geweest bij het essentieel maken van een ander viraal eiwit, UL84, voor virale replicatie in fibroblasten. Deze bevinding suggereert dat IE2 en misschien zijn interacties met UL84 belangrijke functies hebben die uniek zijn voor HCMV-replicatie in epitheelcellen.

uitgestorvenvogels
uitgestorvenvogels

Sequentiemodificatie op aanvraag: zoek en vervang instruments voor nauwkeurige genbewerking in planten

Tot voor kort was ons vermogen om allelische diversiteit in planten te genereren beperkt tot de introductie van varianten van gedomesticeerde en wilde soorten door te kweken through ongecontroleerde recombinatie of het gebruik van chemische en fysische mutagenen-processen die respectievelijk langdurig en kostbaar zijn of geen specificiteit hebben. Genbewerking biedt een snellere en nauwkeurigere manier om nieuwe variatie te creëren, hoewel de toepassing ervan in planten werd gedomineerd door het creëren van korte insertie- en deletiemutaties die leidden tot verlies van genfunctie, voornamelijk als gevolg van de afhankelijkheid van bewerkingsresultaten op het DNA-herstelpad keuzes die intrinsiek zijn aan hogere eukaryoten.

Andere soorten bewerkingen zoals puntmutaties en nauwkeurige en vooraf ontworpen gerichte sequentie-inserties zijn zelden geïmplementeerd, ondanks het feit dat ze middelen bieden om de expressie van doelwitgenen te moduleren of om de functie en stabiliteit van hun eiwitproducten te manipuleren . De afgelopen jaren zijn er verschillende ontwikkelingen ontwikkeld om aangepaste bewerkingen te vergemakkelijken door de keuzes van reparatiepaden te reguleren of door gebruik te maken van alternatieve soorten DNA-reparatie. We hebben de komst gezien van nieuwe instruments voor het bewerken van genen die onafhankelijk zijn van DNA-dubbelstrengsbreukenreparatie en methoden die volledig onafhankelijk zijn van de DNA-reparatieprocessen van de gastheer worden steeds meer onderzocht. Met het doel een uitgebreid overzicht te geven van de state-of-the-art methodologie voor allelvervanging in planten, bespreek ik de adoptie van deze verbeteringen voor plantgenoomengineering.

Gentelling van doelsequentie-opname plaatst drie volledige genoomduplicatiegebeurtenissen in Hibiscus L. (Malvaceae)

Achtergrond:  De grote diversiteit in genoomgrootte en chromosoomaantal van planten is deels te wijten aan polyploïdisatie (dwz genoomverdubbeling). De verschillen in genoomgrootte en chromosoomaantal tussen diploïde plantensoorten kunnen een venster zijn op het intrigerende fenomeen van genoomverdubbeling in het verleden, dat in de loop van de tijd kan worden verdoezeld door het proces van diploïdisatie. Het geslacht Hibiscus L. (Malvaceae) heeft een grote diversiteit aan chromosoomaantallen en een complexe genomische geschiedenis. Hibiscus is ideaal voor het onderzoeken van genomische gebeurtenissen uit het verleden, need hoewel er twee oude genoomduplicatiegebeurtenissen zijn geïdentificeerd, zullen er waarschijnlijk meer worden gevonden vanwege de diversiteit aan chromosoomaantallen. Om de geschiedenis van duplicatiegebeurtenissen van het hele genoom in Hibiscus opnieuw te beoordelen, hebben we drie alternatieve situation’s getest die verschillende polyploïdisatiegebeurtenissen beschrijven.

Resultaten:  Met behulp van het vastleggen van doelsequenties hebben we een nieuwe probeset voor Hibiscus ontworpen en 87 orthologe genen gegenereerd van vier diploïde soorten. We hebben paralogen gedetecteerd in> 54% vermeende single-copy genen. 34 van deze genen werden geselecteerd voor het testen van drie verschillende situation’s voor genoomduplicatie met behulp van gentelling. Alle soorten Hibiscus die werden bemonsterd, deelden één genoomduplicatie met H. syriacus, en één volledige genoomduplicatie vond plaats langs de tak die naar H. syriacus leidde.

Conclusies:  Hier bevestigden we de onafhankelijke genoomverdubbeling die eerder werd gevonden in de lijn die leidde tot H. syriacus en een gedeelde genoomverdubbeling van deze lijn en de relaxation van Hibiscus. Bovendien vonden we een voorheen onontdekte genoomduplicatie die werd gedeeld door de /Pavonia- en /Malvaviscus-clades (beide genesteld in Hibiscus) met het voorkomen van twee kopieën in wat anders single-copy genen waren. Onze resultaten benadrukken de complexiteit van genomische diversiteit in sommige plantengroepen, wat orthologische beoordeling en nauwkeurige fylogenomische gevolgtrekking moeilijk maakt.

Ontwerp-genoomsequentie van Pandrug-resistente Pseudomonas aeruginosa SPA03, geïsoleerd van een patiënt met goedaardige prostaathyperplasie

Het conceptgenoom van pandrug-resistente Pseudomonas aeruginosa-stam SPA03, die behoort tot de wereldwijde hoogrisicosequentie sort 357 (ST357) en werd geïsoleerd uit een patiënt met goedaardige prostaathyperplasie, wordt in dit rapport gepresenteerd.

De genoomassemblage werd gegenereerd door kort gelezen Illumina HiSeq-X Ten en langgelezen Oxford Nanopore Applied sciences MinION-sequentiegegevens te combineren met behulp van de Unicycler-assembler.

KP-457

HY-110397 100mg
EUR 3838

1Kb Plus DNA Marker

20-abx098051
  • EUR 300.00
  • EUR 203.00
  • 2.5 ml
  • 500 ul
  • Shipped within 5-10 working days.

DL2000 Plus DNA Marker

MD101-01 250 μl
EUR 107

DL2000 Plus DNA Marker

MD101-02 500 μl
EUR 113

Peacock Plus Prestained Protein Marker

9-21531
  • EUR 200.00
  • EUR 116.00
  • 500UL
  • 50UL
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 50UL

Human kaliuretic peptide,KP ELISA Kit

201-12-1324 96 tests
EUR 440
  • This kaliuretic peptide ELISA kit is validated to work with samples from whole blood, serum, plasma and cell culture supernatant.
Description: A quantitative ELISA kit for measuring Human in samples from biological fluids.

Human kaliuretic peptide,KP ELISA Kit

CN-03389H1 96T
EUR 438

Human kaliuretic peptide,KP ELISA Kit

CN-03389H2 48T
EUR 289

Human kaliuretic peptide(KP)ELISA Kit

GA-E1340HM-48T 48T
EUR 289

Human kaliuretic peptide(KP)ELISA Kit

GA-E1340HM-96T 96T
EUR 466

Human kaliuretic peptide(KP)ELISA Kit

QY-E02370 96T
EUR 361

100bp DNA Marker Plus-50, Ready-to-use

D1103-050 500 ul
EUR 151

100bp DNA Marker Plus-50, Ready-to-use

D1103-100 2x500 ul
EUR 192

200-2000bp DNA Marker Plus, Ready-to-use

GM401 50loading, 50prep
EUR 60.44
  • Product category: Electrophoresis Related/Ladders - DNA/200-2000 bp

100-5000bp DNA Marker Plus, Ready-to-use

SGM03 50loading, 50prep
EUR 67.4
  • Product category: Electrophoresis Related/Ladders - DNA/100-5000 bp

SureClean Plus

BIO-37047 1 x 5ml Ask for price

SureClean Plus

BIO-37048 2 x 12.5ml Ask for price

2 × Taq Plus Master Mix (Dye Plus)

P212-01 5 ml
EUR 133

2 × Taq Plus Master Mix (Dye Plus)

P212-02 15 ml
EUR 193

2 × Taq Plus Master Mix (Dye Plus)

P212-03 50 ml
EUR 389

2K Plus DNA Marker (8 linear double-stranded DNA bands)

20-abx098046
  • EUR 258.00
  • EUR 189.00
  • 2.5 ml
  • 500 ul
  • Shipped within 5-10 working days.

2K Plus DNA Marker (9 linear double-stranded DNA bands)

20-abx098047
  • EUR 258.00
  • EUR 189.00
  • 2.5 ml
  • 500 ul
  • Shipped within 5-10 working days.

100bp Plus DNA Marker (12 linear double-stranded DNA bands)

20-abx098053
  • EUR 272.00
  • EUR 189.00
  • 2.5 ml
  • 500 ul
  • Shipped within 5-10 working days.

100bp Plus DNA Marker (14 linear double-stranded DNA bands)

20-abx098054
  • EUR 300.00
  • EUR 203.00
  • 2.5 ml
  • 500 ul
  • Shipped within 5-10 working days.

2 × Taq Plus Master Mix II (Dye Plus)

P213-01 5 ml
EUR 134

2 × Taq Plus Master Mix II (Dye Plus)

P213-02 15 ml
EUR 193

2 × Taq Plus Master Mix II (Dye Plus)

P213-03 50 ml
EUR 389

Plus PCR SuperMix

20-abx098888
  • EUR 244.00
  • EUR 467.00
  • 1 ml
  • 5 ml
  • Shipped within 5-10 working days.

SafeView™ Plus

G468 1.0 ml (10000X)
EUR 106

Accuris Taq Plus

PR1000-TP-250 1 PC
EUR 194.99
  • To order instruments in 115V / US plug please delete the 'E' off the order code.European 2 pin plugs will be supplied as standard, please request UK if required.

Accuris Taq Plus

PR1000-TP-500 1 PC
EUR 273.15
  • To order instruments in 115V / US plug please delete the 'E' off the order code.European 2 pin plugs will be supplied as standard, please request UK if required.

Accuris Taq Plus

PR1000-TP-S 1 PC
EUR 69.79
  • To order instruments in 115V / US plug please delete the 'E' off the order code.European 2 pin plugs will be supplied as standard, please request UK if required.

i-BRITE Plus

SF40000-10 10 ml
EUR 244

ACTGene? DNA Marker, 1 kb Plus Ladder, 19 Fragments, 100 loads

ACT-IDMWD2
EUR 149

LAMBDA PLUS STARTER KIT

4069 1/pk
EUR 643
Description: Corning and Axygen Liquid Handling Equipment; Corning Lambda Plus Single Channel Pipettors

AlbuSorb™ PLUS Kit

APK285-100 100 preps
EUR 2029
Description: Albumin Removal Kit

AlbuSorb™ PLUS Kit

APK285-20 20 preps
EUR 521
Description: Albumin Removal Kit

AlbuTrial™ PLUS Kit

AVPS-05 5 preps AlbuSorb™ PLUS & 5 preps AlbuVoid™ PLUS Kit
EUR 521
Description: Albumin Removal Kit

Cellmaxin Plus, 10.5mg/ml

C3319-006 6x1ml
EUR 209

Cellmaxin Plus, 10.5mg/ml

C3319-020 20ml
EUR 313

Taq Plus DNA Polymerase

P201-01 250 U
EUR 123

Taq Plus DNA Polymerase

P201-02 1000 U
EUR 178

Taq Plus DNA Polymerase

P201-03 3000 U
EUR 319

Novel Green PLUS (20000X)

LD003-0500 500 µl
EUR 172

Novel Green PLUS (20000X)

LD003-0500L 5x500 µl
EUR 731

AlbuVoid™ PLUS Kit

NP-AVK-05 5 preps
EUR 405
Description: Albumin Removal Kit

AlbuVoid™ PLUS Kit

NP-AVK10 10 preps
EUR 587
Description: Albumin Removal Kit

SmartBlue PLUS Viewing Glasses

E4000-VG1 1/pack
EUR 88.88
Description: SmartBlue PLUS Viewing Glasses

Bacteria RNA Plus Reagent

R402-01 20 ml
EUR 130

Recombinant Taq Plus DNA Polymerase

7-03631 250U Ask for price

Recombinant Taq Plus DNA Polymerase

7-03632 750U Ask for price

Recombinant Taq Plus DNA Polymerase

7-03633 2,500U Ask for price

Caspase Fluorometric Substrate Set Plus

55R-1316 7 x 25 assays
EUR 1048
Description: Caspase Fluorometric Substrate Set for use in immunoassays activity in the research laboratory

Caspase Colorimetric Substrate Set Plus

55R-1317 7 x 25 assays
EUR 1048
Description: Caspase Fluorometric Substrate Set for use in immunoassays activity in the research laboratory

ECL Plus Western Blotting Substrate

AR1196 50mL(sufficient reagents for 500 cm2 of membrane)
EUR 101

Up Plus RNA Extraction Kit

20-abx098093
  • EUR 370.00
  • EUR 105.00
  • 100 rxns
  • 2 rxns
  • Shipped within 5-10 working days.

KD Plus DNA Polymerase Enzyme

abx071022-100U 100 U
EUR 244
  • Shipped within 5-10 working days.

KD Plus DNA Polymerase Enzyme

abx071022-1200U 1200 U
EUR 899
  • Shipped within 5-10 working days.

KD Plus DNA Polymerase Enzyme

abx071022-200U 200 U
EUR 314
  • Shipped within 5-10 working days.

Taq Plus DNA Polymerase (Recombinant)

abx073522-2500U 2.500 U
EUR 592
  • Shipped within 5-10 working days.

Taq Plus DNA Polymerase (Recombinant)

abx073522-250U 250 U
EUR 230
  • Shipped within 5-10 working days.

Taq Plus DNA Polymerase (Recombinant)

abx073522-750U 750 U
EUR 328
  • Shipped within 5-10 working days.

Citrate Plus (10x) HIER Solution

CPL500 500 ml
EUR 138

Citrate Plus (10x) HIER Solution

CPL999 1000 ml
EUR 205

mTFP-nAb Plus Biotinylated 25µg

ABP-NAB-MTFPPB 25µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

p16-nAb Plus Biotinylated 25µg

ABP-NAB-P16PB 25µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

TNFa-nAb Plus Biotinylated 25µg

ABP-NAB-TNFAPB 25 µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

VEGF-nAb Plus Biotinylated 25µg

ABP-NAB-VEGFPB 25µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

Taq Plus DNA Polymerase (PCR)

G012 250 U (50 ul)
EUR 73

2X PCR Taq Plus MasterMix

G014 5.0 ml (200 Rxns)
EUR 106

Taq Plus DNA Polymerase (PCR)

G040 1000 U (200 ul)
EUR 106

2X PCR Taq Plus MasterMix

G901 25.0 ml (1000 Rxns)
EUR 299

Caspase Fluorometric Substrate Set Plus

K2146-175 7x25 assays
EUR 780

Caspase Colorimetric Substrate Set Plus

K2147-175 7x25 assays
EUR 780

Caspase Fluorometric Substrate Set Plus

K135-7-25
EUR 707

Caspase Colorimetric Substrate Set Plus

K136-7-25
EUR 707

Protein A/G-Agarose Plus

P9303-005 5ml
EUR 334

Protein A/G-Agarose Plus

P9303-010 10ml
EUR 752

Protein A/G-Agarose Plus

P9303-020 20ml
EUR 1279

Protein A/G-Agarose Plus

P9303-050 50ml
EUR 1873

2 × Taq Plus Master Mix

P211-01 5 ml
EUR 134

2 × Taq Plus Master Mix

P211-02 15 ml
EUR 193

2 × Taq Plus Master Mix

P211-03 50 ml
EUR 389

DiscoveryProbe? Natural Product Library Plus

L1049-.1 100 uL/well(10 mM solution)
EUR 3527

DiscoveryProbe? Natural Product Library Plus

L1049-.25 250 uL/well(10 mM solution)
EUR 6253

DiscoveryProbe? Natural Product Library Plus

L1049-5 5 mg/well
EUR 8155

VAHTS Universal Plus Fragmentation Module

N209-01 24 rxn
EUR 376

VAHTS Universal Plus Fragmentation Module

N209-02 96 rxn
EUR 1022

Superfrost® Plus microscope slides

PO103 box (72 slides)
EUR 94.55
Description: Best quality products

Accuris Taq Plus Master Mix

PR1001-TP-1000 1 PC
EUR 827.41
  • To order instruments in 115V / US plug please delete the 'E' off the order code.European 2 pin plugs will be supplied as standard, please request UK if required.

Accuris Taq Plus Master Mix

PR1001-TP-200 1 PC
EUR 242.84
  • To order instruments in 115V / US plug please delete the 'E' off the order code.European 2 pin plugs will be supplied as standard, please request UK if required.

Accuris Taq Plus Master Mix

PR1001-TP-S 1 PC
EUR 69.79
  • To order instruments in 115V / US plug please delete the 'E' off the order code.European 2 pin plugs will be supplied as standard, please request UK if required.

Caspase Fluorometric Substrate Set 2 Plus

55R-1318 9 x 25 assays
EUR 1237
Description: Caspase Fluorometric Substrate Set for use in immunoassays activity in the research laboratory

Caspase Colorimetric Substrate Set 2 Plus

55R-1319 9 x 25 assays
EUR 1237
Description: Caspase Fluorometric Substrate Set for use in immunoassays activity in the research laboratory

bFGF-nAb Plus Biotinylated 25 µg

ABP-NAB-BFGFPB 25 µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

GFP-nAb Plus Biotinylated 25 µg

ABP-NAB-GFPPB 25 µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

mNeonGreen-nAb Plus Biotinylated 25 µg

ABP-NAB-MNGPB 25 µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

p16-nAb Plus Purified Protein 25µg

ABP-NAB-P16AB 25µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

RFP-nAb Plus Biotinylated 25 µg

ABP-NAB-RFPPB 25 µg Ask for price
    • Product line: nAb
    • Brand: Nano Antibodies

Leave a Reply

Your email address will not be published.