Gen Sequenties Pinguinus impennis, dodo, reuzenalk, trekduif
De volledige chloroplast-genoomsequentie van Quercus chungii (Fagaceae) Quercus chungii FPMetcalf, een zeldzame eik die endemisch is in Zuid-China, behoort tot de stam van de samengestelde trichomenbasis (CTB) in de sectie Cyclobalanopsis . Het volledige chloroplast-genoom van de soort werd in deze studie verzameld en geannoteerd. Het circulaire genoom was 160.731 bp groot, met een typische quadripartiete structuur, waaronder een groot single-copy-gebied (LSC, 90.140 […]
Volledige genoomsequentie van een nieuw vispapillomavirus gedetecteerd in gekweekte meerval (Silurus glanis) Een nieuw papillomavirus (PV) werd gedetecteerd in gekweekte meerval (Silurus glanis) in Hongarije en vertoonde klinische symptomen die lijken op die van de ziekte van wels meerval herpesvirus. Het hele genoom van Silurus glanis papillomavirus 1 (SgPV1) werd geïdentificeerd met behulp van next-generation sequencing. Het volledige genoom […]
FGGA-lnc: automatische genontologie-annotatie van lncRNA-sequenties op foundation van secundaire structuren De studie van lange niet-coderende RNA’s (lncRNA’s), groter dan 200 nucleotiden , staat centraal in het begrijpen van de ontwikkeling en progressie van veel complexe ziekten. In tegenstelling tot eiwitten wordt de functionaliteit van lncRNA’s slechts subtiel gecodeerd in hun primaire sequentie. Huidige in-silico lncRNA-annotatiemethoden zijn meestal gebaseerd op […]